Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTNP21246 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTNP21246 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTNP21246 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTNP21246 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTNP21246 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTNP21246 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTNP21246 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTNP21246 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTNP21246 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTNP21246 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTNP21246 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTNP21246 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTNP21246 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTNP21246 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTNP21246 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTNP21246 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTNP21246 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTNP21246 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTNP21246 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTNP21246 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTNP21246 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTNP21246 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTNP21246 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTNP21246 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTNP21246 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTNP21246 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTNP21246 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTNP21246 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTNP21246 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTNP21246 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTNP21246 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTNP21246 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTNP21246 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTNP21246 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTNP21246 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTNP21246 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTNP21246 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTNP21246 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTNP21246 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTNP21246 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTNP21246 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTNP21246 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTNP21246 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTNP21246 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTNP21246 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTNP21246 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTNP21246 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTNP21246 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTNP21246 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTNP21246 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTNP21246 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTNP21246 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTNP21246 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTNP21246 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTNP21246 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTNP21246 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTNP21246 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTNP21246 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTNP21246 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTNP21246 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTNP21246 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTNP21246 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTNP21246 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTNP21246 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTNP21246 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTNP21246 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTNP21246 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTNP21246 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTNP21246 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTNP21246 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTNP21246 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTNP21246 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTNP21246 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTNP21246 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTNP21246 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTNP21246 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTNP21246 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTNP21246 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTNP21246 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTNP21246 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTNP21246 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTNP21246 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTNP21246 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTNP21246 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTNP21246 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTNP21246 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTNP21246 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTNP21246 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTNP21246 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTNP21246 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTNP21246 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTNP21246 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTNP21246 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTNP21246 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTNP21246 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTNP21246 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTNP21246 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTNP21246 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTNP21246 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms