Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms