Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PVALBP20472 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PVALBP20472 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PVALBP20472 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PVALBP20472 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PVALBP20472 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PVALBP20472 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PVALBP20472 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PVALBP20472 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PVALBP20472 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PVALBP20472 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PVALBP20472 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PVALBP20472 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PVALBP20472 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PVALBP20472 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PVALBP20472 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PVALBP20472 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PVALBP20472 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PVALBP20472 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PVALBP20472 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PVALBP20472 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PVALBP20472 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PVALBP20472 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PVALBP20472 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PVALBP20472 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PVALBP20472 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PVALBP20472 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PVALBP20472 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PVALBP20472 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PVALBP20472 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PVALBP20472 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PVALBP20472 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PVALBP20472 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PVALBP20472 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PVALBP20472 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PVALBP20472 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PVALBP20472 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PVALBP20472 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PVALBP20472 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PVALBP20472 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PVALBP20472 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PVALBP20472 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PVALBP20472 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PVALBP20472 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PVALBP20472 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PVALBP20472 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PVALBP20472 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PVALBP20472 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PVALBP20472 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PVALBP20472 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PVALBP20472 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms