Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms