Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCP1P17987 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCP1P17987 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCP1P17987 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCP1P17987 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TCP1P17987 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TCP1P17987 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCP1P17987 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCP1P17987 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCP1P17987 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCP1P17987 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCP1P17987 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCP1P17987 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCP1P17987 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCP1P17987 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCP1P17987 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCP1P17987 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TCP1P17987 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCP1P17987 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCP1P17987 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCP1P17987 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCP1P17987 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCP1P17987 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCP1P17987 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCP1P17987 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCP1P17987 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCP1P17987 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCP1P17987 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCP1P17987 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCP1P17987 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCP1P17987 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCP1P17987 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCP1P17987 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCP1P17987 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCP1P17987 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCP1P17987 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCP1P17987 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCP1P17987 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCP1P17987 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCP1P17987 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCP1P17987 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TCP1P17987 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCP1P17987 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCP1P17987 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCP1P17987 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCP1P17987 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCP1P17987 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCP1P17987 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCP1P17987 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCP1P17987 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCP1P17987 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCP1P17987 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCP1P17987 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCP1P17987 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCP1P17987 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCP1P17987 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCP1P17987 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCP1P17987 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCP1P17987 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCP1P17987 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCP1P17987 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCP1P17987 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCP1P17987 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCP1P17987 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCP1P17987 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCP1P17987 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCP1P17987 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCP1P17987 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCP1P17987 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCP1P17987 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCP1P17987 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCP1P17987 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCP1P17987 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCP1P17987 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCP1P17987 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCP1P17987 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCP1P17987 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCP1P17987 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCP1P17987 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCP1P17987 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCP1P17987 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCP1P17987 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCP1P17987 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCP1P17987 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCP1P17987 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCP1P17987 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCP1P17987 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCP1P17987 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCP1P17987 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TCP1P17987 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCP1P17987 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCP1P17987 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCP1P17987 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCP1P17987 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCP1P17987 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TCP1P17987 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCP1P17987 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCP1P17987 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCP1P17987 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCP1P17987 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms