Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPI1P17947 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPI1P17947 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPI1P17947 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPI1P17947 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPI1P17947 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPI1P17947 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPI1P17947 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPI1P17947 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPI1P17947 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPI1P17947 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPI1P17947 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPI1P17947 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPI1P17947 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPI1P17947 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPI1P17947 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPI1P17947 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPI1P17947 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPI1P17947 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPI1P17947 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPI1P17947 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPI1P17947 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPI1P17947 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPI1P17947 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPI1P17947 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPI1P17947 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPI1P17947 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPI1P17947 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPI1P17947 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPI1P17947 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPI1P17947 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPI1P17947 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPI1P17947 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPI1P17947 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPI1P17947 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPI1P17947 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPI1P17947 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPI1P17947 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPI1P17947 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPI1P17947 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPI1P17947 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPI1P17947 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPI1P17947 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPI1P17947 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPI1P17947 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPI1P17947 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPI1P17947 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPI1P17947 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPI1P17947 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPI1P17947 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPI1P17947 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPI1P17947 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPI1P17947 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPI1P17947 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPI1P17947 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPI1P17947 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPI1P17947 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPI1P17947 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPI1P17947 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPI1P17947 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPI1P17947 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPI1P17947 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPI1P17947 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPI1P17947 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPI1P17947 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPI1P17947 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPI1P17947 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPI1P17947 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPI1P17947 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPI1P17947 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPI1P17947 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPI1P17947 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPI1P17947 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPI1P17947 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPI1P17947 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPI1P17947 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPI1P17947 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPI1P17947 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPI1P17947 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPI1P17947 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPI1P17947 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPI1P17947 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPI1P17947 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPI1P17947 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPI1P17947 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPI1P17947 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPI1P17947 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPI1P17947 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPI1P17947 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPI1P17947 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPI1P17947 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPI1P17947 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPI1P17947 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPI1P17947 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPI1P17947 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPI1P17947 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPI1P17947 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPI1P17947 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPI1P17947 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPI1P17947 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms