Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XBP1P17861 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XBP1P17861 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XBP1P17861 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XBP1P17861 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XBP1P17861 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XBP1P17861 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XBP1P17861 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
XBP1P17861 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XBP1P17861 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XBP1P17861 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XBP1P17861 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XBP1P17861 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XBP1P17861 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XBP1P17861 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XBP1P17861 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XBP1P17861 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XBP1P17861 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XBP1P17861 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XBP1P17861 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XBP1P17861 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XBP1P17861 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XBP1P17861 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XBP1P17861 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XBP1P17861 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
XBP1P17861 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XBP1P17861 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XBP1P17861 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XBP1P17861 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XBP1P17861 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XBP1P17861 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XBP1P17861 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XBP1P17861 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XBP1P17861 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XBP1P17861 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XBP1P17861 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XBP1P17861 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XBP1P17861 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XBP1P17861 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XBP1P17861 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XBP1P17861 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XBP1P17861 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XBP1P17861 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XBP1P17861 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XBP1P17861 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XBP1P17861 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XBP1P17861 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XBP1P17861 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XBP1P17861 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XBP1P17861 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XBP1P17861 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XBP1P17861 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XBP1P17861 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XBP1P17861 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XBP1P17861 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XBP1P17861 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XBP1P17861 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XBP1P17861 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XBP1P17861 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
XBP1P17861 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XBP1P17861 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XBP1P17861 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XBP1P17861 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XBP1P17861 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XBP1P17861 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XBP1P17861 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XBP1P17861 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XBP1P17861 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XBP1P17861 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XBP1P17861 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XBP1P17861 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XBP1P17861 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XBP1P17861 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XBP1P17861 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XBP1P17861 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XBP1P17861 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
XBP1P17861 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
XBP1P17861 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XBP1P17861 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XBP1P17861 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XBP1P17861 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XBP1P17861 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XBP1P17861 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XBP1P17861 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
XBP1P17861 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
XBP1P17861 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XBP1P17861 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
XBP1P17861 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XBP1P17861 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XBP1P17861 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XBP1P17861 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XBP1P17861 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XBP1P17861 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XBP1P17861 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XBP1P17861 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XBP1P17861 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XBP1P17861 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XBP1P17861 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XBP1P17861 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XBP1P17861 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms