Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms