Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPBP14678 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms