Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC5A1P13866 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC5A1P13866 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC5A1P13866 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC5A1P13866 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC5A1P13866 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC5A1P13866 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms