Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTN1P12814 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms