Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL3P10147 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL3P10147 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL3P10147 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL3P10147 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL3P10147 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL3P10147 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL3P10147 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL3P10147 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL3P10147 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL3P10147 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL3P10147 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL3P10147 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL3P10147 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL3P10147 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL3P10147 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL3P10147 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3P10147 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3P10147 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3P10147 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3P10147 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3P10147 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3P10147 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3P10147 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3P10147 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3P10147 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3P10147 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3P10147 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3P10147 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3P10147 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3P10147 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3P10147 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3P10147 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3P10147 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3P10147 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3P10147 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3P10147 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3P10147 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3P10147 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3P10147 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3P10147 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3P10147 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3P10147 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL3P10147 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL3P10147 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL3P10147 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL3P10147 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL3P10147 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL3P10147 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL3P10147 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL3P10147 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL3P10147 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL3P10147 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL3P10147 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL3P10147 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3P10147 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3P10147 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3P10147 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3P10147 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3P10147 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3P10147 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3P10147 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3P10147 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3P10147 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3P10147 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3P10147 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3P10147 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3P10147 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3P10147 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3P10147 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3P10147 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3P10147 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3P10147 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3P10147 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3P10147 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3P10147 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3P10147 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3P10147 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3P10147 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3P10147 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3P10147 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3P10147 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3P10147 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3P10147 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3P10147 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3P10147 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3P10147 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3P10147 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3P10147 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3P10147 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3P10147 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3P10147 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3P10147 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3P10147 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3P10147 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3P10147 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3P10147 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3P10147 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL3P10147 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL3P10147 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms