Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HKR1P10072 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HKR1P10072 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HKR1P10072 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HKR1P10072 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HKR1P10072 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HKR1P10072 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HKR1P10072 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HKR1P10072 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HKR1P10072 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HKR1P10072 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HKR1P10072 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HKR1P10072 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HKR1P10072 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HKR1P10072 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HKR1P10072 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HKR1P10072 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HKR1P10072 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HKR1P10072 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HKR1P10072 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HKR1P10072 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HKR1P10072 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HKR1P10072 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HKR1P10072 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HKR1P10072 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HKR1P10072 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HKR1P10072 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HKR1P10072 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HKR1P10072 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HKR1P10072 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HKR1P10072 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HKR1P10072 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HKR1P10072 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HKR1P10072 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HKR1P10072 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HKR1P10072 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HKR1P10072 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HKR1P10072 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HKR1P10072 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HKR1P10072 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HKR1P10072 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HKR1P10072 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HKR1P10072 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HKR1P10072 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HKR1P10072 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HKR1P10072 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HKR1P10072 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HKR1P10072 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HKR1P10072 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HKR1P10072 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HKR1P10072 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HKR1P10072 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HKR1P10072 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HKR1P10072 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HKR1P10072 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HKR1P10072 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HKR1P10072 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HKR1P10072 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HKR1P10072 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HKR1P10072 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HKR1P10072 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HKR1P10072 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HKR1P10072 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HKR1P10072 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HKR1P10072 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HKR1P10072 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HKR1P10072 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HKR1P10072 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HKR1P10072 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HKR1P10072 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HKR1P10072 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HKR1P10072 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HKR1P10072 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HKR1P10072 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HKR1P10072 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HKR1P10072 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HKR1P10072 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HKR1P10072 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HKR1P10072 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HKR1P10072 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HKR1P10072 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HKR1P10072 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HKR1P10072 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HKR1P10072 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HKR1P10072 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HKR1P10072 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HKR1P10072 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HKR1P10072 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HKR1P10072 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HKR1P10072 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HKR1P10072 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HKR1P10072 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HKR1P10072 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HKR1P10072 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HKR1P10072 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HKR1P10072 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HKR1P10072 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HKR1P10072 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HKR1P10072 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HKR1P10072 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms