Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms