Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBSLP0DN79 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms