Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP2CP0DJJ0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms