Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms