Protein–RNA interactions for Protein: P09497

CLTB, Clathrin light chain B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTBP09497 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTBP09497 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTBP09497 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTBP09497 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTBP09497 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTBP09497 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTBP09497 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTBP09497 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTBP09497 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTBP09497 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTBP09497 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTBP09497 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTBP09497 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTBP09497 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTBP09497 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTBP09497 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTBP09497 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTBP09497 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTBP09497 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTBP09497 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTBP09497 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTBP09497 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTBP09497 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTBP09497 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTBP09497 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTBP09497 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTBP09497 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTBP09497 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTBP09497 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTBP09497 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTBP09497 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTBP09497 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTBP09497 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTBP09497 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTBP09497 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTBP09497 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTBP09497 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTBP09497 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTBP09497 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTBP09497 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTBP09497 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTBP09497 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTBP09497 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTBP09497 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTBP09497 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTBP09497 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTBP09497 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTBP09497 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTBP09497 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTBP09497 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTBP09497 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTBP09497 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTBP09497 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTBP09497 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTBP09497 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTBP09497 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTBP09497 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTBP09497 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTBP09497 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTBP09497 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTBP09497 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTBP09497 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLTBP09497 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLTBP09497 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTBP09497 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTBP09497 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTBP09497 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTBP09497 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTBP09497 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTBP09497 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTBP09497 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTBP09497 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTBP09497 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTBP09497 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTBP09497 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTBP09497 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTBP09497 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTBP09497 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTBP09497 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTBP09497 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTBP09497 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTBP09497 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTBP09497 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTBP09497 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTBP09497 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTBP09497 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTBP09497 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTBP09497 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTBP09497 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTBP09497 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTBP09497 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTBP09497 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTBP09497 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTBP09497 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTBP09497 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTBP09497 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTBP09497 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTBP09497 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTBP09497 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTBP09497 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms