Protein–RNA interactions for Protein: P09341

CXCL1, Growth-regulated alpha protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL1P09341 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms