Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms