Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB1P08034 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB1P08034 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB1P08034 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB1P08034 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB1P08034 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB1P08034 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB1P08034 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB1P08034 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB1P08034 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB1P08034 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB1P08034 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB1P08034 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB1P08034 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB1P08034 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB1P08034 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB1P08034 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB1P08034 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB1P08034 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB1P08034 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB1P08034 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB1P08034 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB1P08034 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB1P08034 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB1P08034 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB1P08034 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB1P08034 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB1P08034 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB1P08034 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB1P08034 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB1P08034 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB1P08034 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB1P08034 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB1P08034 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB1P08034 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB1P08034 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB1P08034 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB1P08034 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB1P08034 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB1P08034 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB1P08034 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB1P08034 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB1P08034 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB1P08034 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB1P08034 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB1P08034 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB1P08034 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB1P08034 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB1P08034 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB1P08034 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB1P08034 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB1P08034 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB1P08034 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB1P08034 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB1P08034 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB1P08034 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB1P08034 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB1P08034 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB1P08034 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB1P08034 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB1P08034 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB1P08034 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB1P08034 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB1P08034 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB1P08034 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB1P08034 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB1P08034 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB1P08034 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB1P08034 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB1P08034 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB1P08034 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB1P08034 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB1P08034 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB1P08034 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB1P08034 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB1P08034 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB1P08034 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB1P08034 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB1P08034 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB1P08034 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB1P08034 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB1P08034 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJB1P08034 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB1P08034 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB1P08034 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB1P08034 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB1P08034 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB1P08034 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB1P08034 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB1P08034 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB1P08034 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB1P08034 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB1P08034 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB1P08034 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB1P08034 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB1P08034 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB1P08034 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB1P08034 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB1P08034 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB1P08034 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms