Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC3P02656 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC3P02656 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC3P02656 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC3P02656 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC3P02656 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC3P02656 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC3P02656 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC3P02656 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC3P02656 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC3P02656 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC3P02656 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC3P02656 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC3P02656 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC3P02656 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOC3P02656 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOC3P02656 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOC3P02656 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC3P02656 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC3P02656 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC3P02656 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC3P02656 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC3P02656 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC3P02656 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC3P02656 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC3P02656 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC3P02656 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC3P02656 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC3P02656 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC3P02656 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC3P02656 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC3P02656 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC3P02656 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC3P02656 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC3P02656 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC3P02656 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC3P02656 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC3P02656 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOC3P02656 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOC3P02656 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
APOC3P02656 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOC3P02656 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOC3P02656 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms