Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMP1P01033 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms