Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL1O95922 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL1O95922 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTLL1O95922 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTLL1O95922 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TTLL1O95922 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL1O95922 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms