Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX58O95786 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX58O95786 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX58O95786 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX58O95786 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX58O95786 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX58O95786 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX58O95786 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX58O95786 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX58O95786 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX58O95786 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX58O95786 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX58O95786 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX58O95786 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX58O95786 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX58O95786 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX58O95786 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX58O95786 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX58O95786 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX58O95786 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX58O95786 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX58O95786 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX58O95786 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX58O95786 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX58O95786 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX58O95786 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX58O95786 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX58O95786 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX58O95786 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX58O95786 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX58O95786 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX58O95786 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX58O95786 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX58O95786 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX58O95786 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX58O95786 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX58O95786 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX58O95786 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX58O95786 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX58O95786 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX58O95786 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX58O95786 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX58O95786 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX58O95786 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX58O95786 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX58O95786 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX58O95786 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX58O95786 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX58O95786 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX58O95786 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX58O95786 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX58O95786 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX58O95786 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX58O95786 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX58O95786 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX58O95786 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX58O95786 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX58O95786 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX58O95786 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX58O95786 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX58O95786 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX58O95786 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX58O95786 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX58O95786 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX58O95786 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX58O95786 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX58O95786 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX58O95786 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX58O95786 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX58O95786 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX58O95786 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX58O95786 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX58O95786 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX58O95786 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX58O95786 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX58O95786 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX58O95786 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX58O95786 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX58O95786 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX58O95786 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX58O95786 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX58O95786 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX58O95786 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DDX58O95786 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DDX58O95786 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX58O95786 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX58O95786 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX58O95786 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX58O95786 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX58O95786 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX58O95786 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX58O95786 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX58O95786 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX58O95786 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX58O95786 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX58O95786 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX58O95786 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX58O95786 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX58O95786 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX58O95786 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms