Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN9O95484 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN9O95484 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms