Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE8BO95263 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE8BO95263 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE8BO95263 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE8BO95263 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE8BO95263 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE8BO95263 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE8BO95263 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms