Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD4O95243 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD4O95243 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD4O95243 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD4O95243 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD4O95243 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD4O95243 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD4O95243 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD4O95243 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD4O95243 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD4O95243 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD4O95243 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD4O95243 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD4O95243 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD4O95243 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD4O95243 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD4O95243 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD4O95243 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD4O95243 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD4O95243 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD4O95243 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD4O95243 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD4O95243 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD4O95243 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD4O95243 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD4O95243 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD4O95243 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD4O95243 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD4O95243 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD4O95243 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD4O95243 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD4O95243 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD4O95243 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD4O95243 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD4O95243 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD4O95243 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD4O95243 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD4O95243 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD4O95243 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD4O95243 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD4O95243 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD4O95243 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD4O95243 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD4O95243 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD4O95243 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD4O95243 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD4O95243 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD4O95243 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD4O95243 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD4O95243 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD4O95243 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD4O95243 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD4O95243 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD4O95243 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD4O95243 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD4O95243 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD4O95243 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD4O95243 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD4O95243 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD4O95243 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD4O95243 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD4O95243 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD4O95243 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD4O95243 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD4O95243 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD4O95243 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD4O95243 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD4O95243 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD4O95243 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD4O95243 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD4O95243 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD4O95243 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD4O95243 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD4O95243 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD4O95243 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD4O95243 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD4O95243 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD4O95243 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD4O95243 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD4O95243 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD4O95243 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD4O95243 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD4O95243 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MBD4O95243 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MBD4O95243 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MBD4O95243 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MBD4O95243 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD4O95243 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD4O95243 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD4O95243 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD4O95243 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD4O95243 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD4O95243 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD4O95243 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD4O95243 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD4O95243 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD4O95243 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD4O95243 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD4O95243 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD4O95243 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms