Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UFL1O94874 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UFL1O94874 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UFL1O94874 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UFL1O94874 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UFL1O94874 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UFL1O94874 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UFL1O94874 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UFL1O94874 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UFL1O94874 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UFL1O94874 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UFL1O94874 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UFL1O94874 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UFL1O94874 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UFL1O94874 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UFL1O94874 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UFL1O94874 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UFL1O94874 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UFL1O94874 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UFL1O94874 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UFL1O94874 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UFL1O94874 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UFL1O94874 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UFL1O94874 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UFL1O94874 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UFL1O94874 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UFL1O94874 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UFL1O94874 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UFL1O94874 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UFL1O94874 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UFL1O94874 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UFL1O94874 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UFL1O94874 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UFL1O94874 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UFL1O94874 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UFL1O94874 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UFL1O94874 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UFL1O94874 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UFL1O94874 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UFL1O94874 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UFL1O94874 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UFL1O94874 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UFL1O94874 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UFL1O94874 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UFL1O94874 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UFL1O94874 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UFL1O94874 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UFL1O94874 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UFL1O94874 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UFL1O94874 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UFL1O94874 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UFL1O94874 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UFL1O94874 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UFL1O94874 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UFL1O94874 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UFL1O94874 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UFL1O94874 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UFL1O94874 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UFL1O94874 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UFL1O94874 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UFL1O94874 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UFL1O94874 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UFL1O94874 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UFL1O94874 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UFL1O94874 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UFL1O94874 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UFL1O94874 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UFL1O94874 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UFL1O94874 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UFL1O94874 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UFL1O94874 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UFL1O94874 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UFL1O94874 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UFL1O94874 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UFL1O94874 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UFL1O94874 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UFL1O94874 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UFL1O94874 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UFL1O94874 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UFL1O94874 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UFL1O94874 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UFL1O94874 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UFL1O94874 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UFL1O94874 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UFL1O94874 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UFL1O94874 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UFL1O94874 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UFL1O94874 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UFL1O94874 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UFL1O94874 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UFL1O94874 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UFL1O94874 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UFL1O94874 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UFL1O94874 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UFL1O94874 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UFL1O94874 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UFL1O94874 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UFL1O94874 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UFL1O94874 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UFL1O94874 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms