Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FLOT1O75955 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms