Protein–RNA interactions for Protein: O75604

USP2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP2O75604 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP2O75604 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP2O75604 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP2O75604 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP2O75604 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP2O75604 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP2O75604 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP2O75604 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP2O75604 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP2O75604 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP2O75604 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP2O75604 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP2O75604 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP2O75604 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP2O75604 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP2O75604 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP2O75604 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP2O75604 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP2O75604 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP2O75604 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP2O75604 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP2O75604 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP2O75604 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP2O75604 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP2O75604 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP2O75604 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP2O75604 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP2O75604 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP2O75604 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP2O75604 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP2O75604 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP2O75604 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP2O75604 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP2O75604 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP2O75604 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP2O75604 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP2O75604 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP2O75604 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP2O75604 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP2O75604 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP2O75604 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP2O75604 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP2O75604 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP2O75604 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP2O75604 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP2O75604 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP2O75604 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP2O75604 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP2O75604 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP2O75604 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP2O75604 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP2O75604 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP2O75604 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP2O75604 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP2O75604 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP2O75604 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP2O75604 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP2O75604 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP2O75604 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP2O75604 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP2O75604 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP2O75604 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP2O75604 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP2O75604 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP2O75604 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP2O75604 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP2O75604 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP2O75604 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP2O75604 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP2O75604 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP2O75604 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP2O75604 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP2O75604 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP2O75604 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP2O75604 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP2O75604 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP2O75604 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP2O75604 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP2O75604 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP2O75604 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP2O75604 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP2O75604 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP2O75604 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP2O75604 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP2O75604 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP2O75604 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP2O75604 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP2O75604 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP2O75604 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP2O75604 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP2O75604 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP2O75604 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP2O75604 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP2O75604 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP2O75604 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP2O75604 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP2O75604 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP2O75604 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP2O75604 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP2O75604 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms