Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA2O75334 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA2O75334 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms