Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms