Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3BO75182 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3BO75182 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3BO75182 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3BO75182 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3BO75182 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SIN3BO75182 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3BO75182 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3BO75182 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3BO75182 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3BO75182 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3BO75182 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3BO75182 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3BO75182 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SIN3BO75182 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3BO75182 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3BO75182 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3BO75182 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3BO75182 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3BO75182 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIN3BO75182 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms