Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA2O43921 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms