Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKAB2O43741 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms