Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATCO43716 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATCO43716 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATCO43716 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GATCO43716 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATCO43716 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATCO43716 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATCO43716 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATCO43716 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATCO43716 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATCO43716 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATCO43716 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATCO43716 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATCO43716 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATCO43716 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATCO43716 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATCO43716 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GATCO43716 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATCO43716 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATCO43716 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATCO43716 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATCO43716 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATCO43716 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATCO43716 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATCO43716 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATCO43716 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATCO43716 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATCO43716 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATCO43716 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATCO43716 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATCO43716 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATCO43716 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATCO43716 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATCO43716 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATCO43716 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATCO43716 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATCO43716 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATCO43716 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATCO43716 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATCO43716 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATCO43716 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATCO43716 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATCO43716 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATCO43716 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATCO43716 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATCO43716 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATCO43716 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATCO43716 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATCO43716 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATCO43716 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms