Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF3O43395 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRPF3O43395 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms