Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA2O43364 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms