Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VGFO15240 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VGFO15240 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VGFO15240 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VGFO15240 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VGFO15240 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VGFO15240 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VGFO15240 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VGFO15240 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VGFO15240 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VGFO15240 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VGFO15240 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
VGFO15240 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
VGFO15240 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VGFO15240 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VGFO15240 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VGFO15240 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VGFO15240 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VGFO15240 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
VGFO15240 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VGFO15240 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VGFO15240 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VGFO15240 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
VGFO15240 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
VGFO15240 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
VGFO15240 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VGFO15240 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
VGFO15240 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VGFO15240 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VGFO15240 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VGFO15240 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VGFO15240 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VGFO15240 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VGFO15240 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VGFO15240 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
VGFO15240 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VGFO15240 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
VGFO15240 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
VGFO15240 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
VGFO15240 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
VGFO15240 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
VGFO15240 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
VGFO15240 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VGFO15240 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VGFO15240 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
VGFO15240 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VGFO15240 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VGFO15240 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
VGFO15240 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VGFO15240 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VGFO15240 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
VGFO15240 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
VGFO15240 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VGFO15240 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
VGFO15240 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VGFO15240 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VGFO15240 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VGFO15240 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
VGFO15240 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VGFO15240 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
VGFO15240 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
VGFO15240 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VGFO15240 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VGFO15240 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
VGFO15240 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VGFO15240 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VGFO15240 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VGFO15240 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VGFO15240 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
VGFO15240 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
VGFO15240 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
VGFO15240 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VGFO15240 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VGFO15240 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VGFO15240 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VGFO15240 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VGFO15240 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VGFO15240 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VGFO15240 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VGFO15240 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VGFO15240 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VGFO15240 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VGFO15240 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VGFO15240 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VGFO15240 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VGFO15240 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VGFO15240 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VGFO15240 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VGFO15240 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VGFO15240 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VGFO15240 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VGFO15240 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VGFO15240 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VGFO15240 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VGFO15240 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VGFO15240 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VGFO15240 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VGFO15240 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VGFO15240 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VGFO15240 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
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