Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCF2LO15068 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCF2LO15068 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms