Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms