Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIP1O00291 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIP1O00291 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIP1O00291 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIP1O00291 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIP1O00291 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIP1O00291 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIP1O00291 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIP1O00291 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIP1O00291 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIP1O00291 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIP1O00291 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIP1O00291 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIP1O00291 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIP1O00291 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIP1O00291 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIP1O00291 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIP1O00291 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIP1O00291 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIP1O00291 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIP1O00291 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIP1O00291 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIP1O00291 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIP1O00291 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIP1O00291 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIP1O00291 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIP1O00291 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIP1O00291 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIP1O00291 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIP1O00291 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIP1O00291 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIP1O00291 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HIP1O00291 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HIP1O00291 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HIP1O00291 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIP1O00291 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIP1O00291 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIP1O00291 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIP1O00291 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIP1O00291 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIP1O00291 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIP1O00291 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIP1O00291 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIP1O00291 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIP1O00291 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIP1O00291 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIP1O00291 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIP1O00291 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIP1O00291 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIP1O00291 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIP1O00291 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HIP1O00291 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIP1O00291 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIP1O00291 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HIP1O00291 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIP1O00291 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HIP1O00291 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HIP1O00291 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIP1O00291 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIP1O00291 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIP1O00291 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIP1O00291 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIP1O00291 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIP1O00291 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIP1O00291 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIP1O00291 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIP1O00291 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIP1O00291 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIP1O00291 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIP1O00291 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIP1O00291 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIP1O00291 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
HIP1O00291 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HIP1O00291 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HIP1O00291 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIP1O00291 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIP1O00291 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIP1O00291 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HIP1O00291 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIP1O00291 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIP1O00291 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIP1O00291 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIP1O00291 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIP1O00291 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIP1O00291 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIP1O00291 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIP1O00291 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HIP1O00291 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIP1O00291 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIP1O00291 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIP1O00291 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIP1O00291 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIP1O00291 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIP1O00291 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIP1O00291 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HIP1O00291 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIP1O00291 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIP1O00291 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HIP1O00291 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIP1O00291 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms