Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KR12 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KR12 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KR12 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KR12 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KR12 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KR12 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KR12 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KR12 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KR12 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KR12 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KR12 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KR12 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KR12 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KR12 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KR12 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KR12 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KR12 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KR12 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
J3KR12 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
J3KR12 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
J3KR12 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
J3KR12 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
J3KR12 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
J3KR12 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
J3KR12 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
J3KR12 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
J3KR12 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
J3KR12 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3KR12 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3KR12 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
J3KR12 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3KR12 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3KR12 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3KR12 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3KR12 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
J3KR12 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3KR12 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3KR12 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3KR12 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3KR12 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3KR12 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3KR12 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3KR12 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3KR12 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3KR12 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3KR12 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
J3KR12 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
J3KR12 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3KR12 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3KR12 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3KR12 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3KR12 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3KR12 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3KR12 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3KR12 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KR12 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KR12 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KR12 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KR12 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KR12 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KR12 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KR12 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KR12 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KR12 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KR12 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KR12 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KR12 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KR12 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KR12 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KR12 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KR12 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KR12 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KR12 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KR12 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KR12 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KR12 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KR12 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KR12 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KR12 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3KR12 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3KR12 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3KR12 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3KR12 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3KR12 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3KR12 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3KR12 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3KR12 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3KR12 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3KR12 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3KR12 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3KR12 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
J3KR12 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3KR12 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3KR12 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3KR12 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3KR12 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3KR12 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3KR12 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3KR12 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms