Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
H7C1W4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
H7C1W4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
H7C1W4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H7C1W4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H7C1W4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H7C1W4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
H7C1W4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H7C1W4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H7C1W4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H7C1W4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H7C1W4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H7C1W4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H7C1W4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H7C1W4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H7C1W4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H7C1W4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H7C1W4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H7C1W4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
H7C1W4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
H7C1W4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
H7C1W4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
H7C1W4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H7C1W4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H7C1W4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
H7C1W4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H7C1W4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H7C1W4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H7C1W4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H7C1W4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H7C1W4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H7C1W4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H7C1W4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H7C1W4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H7C1W4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H7C1W4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H7C1W4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H7C1W4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1W4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1W4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1W4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1W4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1W4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1W4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1W4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1W4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1W4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1W4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1W4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1W4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1W4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1W4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1W4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1W4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H7C1W4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
H7C1W4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
H7C1W4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H7C1W4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
H7C1W4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H7C1W4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H7C1W4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H7C1W4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H7C1W4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1W4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1W4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1W4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1W4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1W4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1W4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1W4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1W4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1W4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1W4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1W4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1W4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1W4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1W4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1W4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1W4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1W4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1W4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1W4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1W4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1W4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
H7C1W4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C1W4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C1W4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C1W4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C1W4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C1W4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C1W4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C1W4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C1W4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C1W4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C1W4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C1W4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C1W4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C1W4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C1W4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C1W4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms