Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms