Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L13C9JLJ4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms