Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
ERVV-1B6SEH8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms