Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms