Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms